Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Coa4-202ENSMUST00000120454 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm12376-201ENSMUST00000120538 607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm12977-201ENSMUST00000133742 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm11827-201ENSMUST00000142297 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm14250-201ENSMUST00000148458 566 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm3752-202ENSMUST00000167833 450 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm10128-201ENSMUST00000171360 615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm2956-202ENSMUST00000178722 450 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm22347-201ENSMUST00000180276 132 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm28167-201ENSMUST00000187644 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm10340-202ENSMUST00000188235 615 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Stard3nl-205ENSMUST00000197565 1391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Mkln1os-201ENSMUST00000139185 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Rufy3-202ENSMUST00000196686 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Ppp1r11-203ENSMUST00000174711 520 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Pf4-203ENSMUST00000202625 411 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Rpl19-ps2-201ENSMUST00000219540 590 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm19173-201ENSMUST00000204494 1523 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm15423-201ENSMUST00000150600 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gpx6-201ENSMUST00000004453 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 AC167565.2-201ENSMUST00000227042 1870 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Catspere1-201ENSMUST00000194528 2949 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm10339-202ENSMUST00000181509 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 4930470P17Rik-201ENSMUST00000062355 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm13864-201ENSMUST00000119745 785 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm14983-201ENSMUST00000121551 323 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm15777-201ENSMUST00000123463 876 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm17228-201ENSMUST00000165006 491 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Plscr5-201ENSMUST00000179751 1191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm37118-201ENSMUST00000194328 406 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 AC162893.1-201ENSMUST00000207732 1085 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm42402-201ENSMUST00000208341 1054 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Rpl7a-ps8-201ENSMUST00000094754 801 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Pdcd1lg2-201ENSMUST00000112576 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Calcoco2-201ENSMUST00000068686 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm18901-201ENSMUST00000197840 1444 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Spc25-209ENSMUST00000167875 1194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Zfp422-ps-201ENSMUST00000182230 706 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm5043-201ENSMUST00000202103 820 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm39128-201ENSMUST00000208237 1094 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 3110009E18Rik-202ENSMUST00000056038 401 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms