Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ptk2P34152 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ptk2P34152 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ptk2P34152 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ptk2P34152 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ptk2P34152 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ptk2P34152 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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