Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nfkb1P25799 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms