Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Tsta3P23591 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Tsta3P23591 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Tsta3P23591 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Tsta3P23591 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tsta3P23591 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms