Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18533 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18533 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18533 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18533 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18533 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18533 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18533 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18533 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18533 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18533 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18533 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18533 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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