Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa-rs1P17533 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms