Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Irf1P15314 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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