Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Serpini2-201ENSMUST00000039047 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Tctex1d2-202ENSMUST00000080316 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxb4P10284 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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