Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01648 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01648 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P01648 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms