Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms