Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms