Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usf3B2RUQ2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms