Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprbB2RU80 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms