Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnf6Q9DBU5 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnf6Q9DBU5 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnf6Q9DBU5 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnf6Q9DBU5 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnf6Q9DBU5 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf6Q9DBU5 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf6Q9DBU5 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf6Q9DBU5 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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