Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 AC153864.1-201ENSMUST00000218482 523 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Ola1-202ENSMUST00000100015 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms