Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Rhobtb3Q9CTN4 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rhobtb3Q9CTN4 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms