Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 D530037P16Rik-201ENSMUST00000199255 1027 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fcf1Q9CTH6 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms