Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Commd4Q9CQ02 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Commd4Q9CQ02 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Commd4Q9CQ02 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Commd4Q9CQ02 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Commd4Q9CQ02 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Commd4Q9CQ02 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms