Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg3Q9CPX6 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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