Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Usp16Q99LG0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp16Q99LG0 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Usp16Q99LG0 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Usp16Q99LG0 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Usp16Q99LG0 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Usp16Q99LG0 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Usp16Q99LG0 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp16Q99LG0 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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