Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms