Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms