Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Trappc12Q8K2L8 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Trappc12Q8K2L8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Trappc12Q8K2L8 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Trappc12Q8K2L8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Trappc12Q8K2L8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Trappc12Q8K2L8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Trappc12Q8K2L8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Trappc12Q8K2L8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Trappc12Q8K2L8 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Trappc12Q8K2L8 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms