Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms