Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms