Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Rsl24d1-203ENSMUST00000165177 597 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm26205-201ENSMUST00000082907 134 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm24180-201ENSMUST00000179961 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 CT025547.1-201ENSMUST00000225127 578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp54Q8BL06 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 C8b-202ENSMUST00000065072 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm13197-201ENSMUST00000117204 225 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp54Q8BL06 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Dtymk-203ENSMUST00000112893 1040 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp54Q8BL06 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms