Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atg9aQ68FE2 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms