Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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BcanQ61361 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BcanQ61361 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms