Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g16-201ENSMUST00000025925 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Syncrip-207ENSMUST00000174269 3286 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Pwp1-201ENSMUST00000001836 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Slc28a2-202ENSMUST00000110524 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Ephb4-205ENSMUST00000166239 3741 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Fgd1-202ENSMUST00000112685 3240 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm43135-201ENSMUST00000196442 3462 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 AC159813.1-201ENSMUST00000222671 2263 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Aldob-201ENSMUST00000029987 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms