Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Kdm4dQ3U2K5 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Kdm4dQ3U2K5 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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Kdm4dQ3U2K5 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Kdm4dQ3U2K5 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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