Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms