Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms