Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NfiaQ02780 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NfiaQ02780 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms