Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nphp4P59240 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms