Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pbx1P41778 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pbx1P41778 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pbx1P41778 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pbx1P41778 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pbx1P41778 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pbx1P41778 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pbx1P41778 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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