Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm11464-201ENSMUST00000146963 537 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm20945-201ENSMUST00000178122 1145 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 CT030664.1-201ENSMUST00000223639 908 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd1P40201 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Asb5-201ENSMUST00000033918 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm14856-201ENSMUST00000121548 613 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm16104-201ENSMUST00000156260 401 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm8907-201ENSMUST00000182240 1003 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm27395-201ENSMUST00000183938 460 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm38941-201ENSMUST00000208606 529 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 AC124484.1-201ENSMUST00000223212 652 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 AC123692.1-201ENSMUST00000227514 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Defa21-201ENSMUST00000076754 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Sav1-201ENSMUST00000021467 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Nectin3-205ENSMUST00000121245 953 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 4933428C19Rik-201ENSMUST00000146043 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 3300005D01Rik-204ENSMUST00000181484 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Cib3-201ENSMUST00000098630 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Trpc5-201ENSMUST00000040184 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd1P40201 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Calhm1-201ENSMUST00000111813 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Ucma-202ENSMUST00000115010 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 1810019D21Rik-203ENSMUST00000145343 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm13855-201ENSMUST00000145644 744 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm17033-201ENSMUST00000146663 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm8203-201ENSMUST00000173192 387 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Siglech-208ENSMUST00000173835 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Il19-204ENSMUST00000187916 720 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Etv3l-201ENSMUST00000193196 325 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm45795-201ENSMUST00000211847 400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 AC159899.1-201ENSMUST00000214024 733 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 AC165260.2-202ENSMUST00000224998 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gpr160-201ENSMUST00000046748 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Tbce-201ENSMUST00000039894 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Nr1h4-202ENSMUST00000105296 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms