Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Katna1-201ENSMUST00000019929 1774 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Trex1-202ENSMUST00000112053 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm16548-201ENSMUST00000133341 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm11493-201ENSMUST00000134567 566 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 1700018A04Rik-203ENSMUST00000150418 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm16104-201ENSMUST00000156260 401 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm44767-201ENSMUST00000206634 469 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 AC165260.2-202ENSMUST00000224998 631 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Rpl14-ps1-201ENSMUST00000026901 653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm14735-201ENSMUST00000121772 3088 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm12619-201ENSMUST00000117369 385 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm15363-201ENSMUST00000118897 631 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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PtprmP28828 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PtprmP28828 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Clec10a-202ENSMUST00000102571 1496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Pdcd1lg2-201ENSMUST00000112576 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PtprmP28828 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 C8b-202ENSMUST00000065072 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Sectm1a-202ENSMUST00000100126 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Gm12004-201ENSMUST00000117869 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtprmP28828 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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