Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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