Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Vps8-202ENSMUST00000096192 4942 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms