Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 B430010I23Rik-201ENSMUST00000123703 2349 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Patj-205ENSMUST00000107030 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Kif26b-202ENSMUST00000161017 13749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Sele-201ENSMUST00000027874 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm44198-201ENSMUST00000203063 2636 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm31135-201ENSMUST00000208460 1782 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Plec-209ENSMUST00000089610 14972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 C7-201ENSMUST00000110689 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Lrrc71-201ENSMUST00000023846 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm42633-201ENSMUST00000198853 2764 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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