Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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