Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms