Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Sp100O35892 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Sp100O35892 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Sp100O35892 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Sp100O35892 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Sp100O35892 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Sp100O35892 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Sp100O35892 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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