Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
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BC024978J3QPC3 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC024978J3QPC3 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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