Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Srp72F8VQC1 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Srp72F8VQC1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Srp72F8VQC1 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Srp72F8VQC1 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srp72F8VQC1 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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