Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm10378F6XQQ1 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm10378F6XQQ1 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms