Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm17555F6U8B9 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms