Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Taf4E9QAP7 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Taf4E9QAP7 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Taf4E9QAP7 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Taf4E9QAP7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Taf4E9QAP7 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms