Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms