Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PtprfA2A8L5 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PtprfA2A8L5 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PtprfA2A8L5 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PtprfA2A8L5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprfA2A8L5 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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